More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3652 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  100 
 
 
431 aa  858    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  50.81 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  46.14 
 
 
447 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  46.14 
 
 
447 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  45.64 
 
 
447 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  44.68 
 
 
444 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  43.78 
 
 
443 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  45.73 
 
 
450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  42.36 
 
 
438 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  44.55 
 
 
464 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  39.14 
 
 
417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  39.52 
 
 
430 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  40.13 
 
 
409 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  40.75 
 
 
405 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  41.61 
 
 
426 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.11 
 
 
410 aa  209  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  39.06 
 
 
406 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  40.13 
 
 
406 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  41.59 
 
 
405 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  41.16 
 
 
418 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  40.44 
 
 
402 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  37.06 
 
 
409 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.54 
 
 
401 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.96 
 
 
411 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  40.96 
 
 
412 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.45 
 
 
402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  40.75 
 
 
398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.62 
 
 
417 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  37.69 
 
 
402 aa  196  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  39 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.73 
 
 
399 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  37.85 
 
 
407 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  38.67 
 
 
411 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  38.67 
 
 
411 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  38 
 
 
411 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  38.67 
 
 
411 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  38.67 
 
 
411 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  38.67 
 
 
411 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.59 
 
 
410 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  38.93 
 
 
411 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  38.59 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40 
 
 
417 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  38 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  37.3 
 
 
417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  38.87 
 
 
408 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.96 
 
 
420 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  35.55 
 
 
409 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  38.87 
 
 
404 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  38.5 
 
 
399 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  34.64 
 
 
430 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  35.87 
 
 
400 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  35.5 
 
 
396 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  36.25 
 
 
380 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  35.45 
 
 
411 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  31.38 
 
 
411 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.25 
 
 
411 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  37.88 
 
 
411 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  36.99 
 
 
412 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.73 
 
 
401 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  38.05 
 
 
407 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  38.06 
 
 
412 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  40.52 
 
 
411 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  36.64 
 
 
401 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  34.95 
 
 
399 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  39.53 
 
 
423 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  39.44 
 
 
400 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  31.08 
 
 
411 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  34.38 
 
 
415 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  39.81 
 
 
398 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.31 
 
 
412 aa  176  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  36.02 
 
 
399 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  34.43 
 
 
408 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  36.51 
 
 
396 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  36.64 
 
 
412 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.76 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  37.66 
 
 
398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  38.61 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.6 
 
 
408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  35.75 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.33 
 
 
436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  36.14 
 
 
395 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  36.89 
 
 
403 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  30.96 
 
 
411 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  36.93 
 
 
423 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  34.15 
 
 
408 aa  173  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  30.46 
 
 
408 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  37.84 
 
 
410 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.71 
 
 
394 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  38.46 
 
 
400 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  37.24 
 
 
398 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  34.6 
 
 
411 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  34.6 
 
 
394 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  34.51 
 
 
395 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.69 
 
 
405 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  38.06 
 
 
402 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  39.3 
 
 
404 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  34.6 
 
 
394 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  34.76 
 
 
414 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  35.4 
 
 
407 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  33.69 
 
 
410 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>