120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3623 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  589  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  45.13 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  42.04 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  32.1 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  33.48 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  33.48 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  33.48 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  33.86 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  33.86 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  34.02 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  32.33 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  31.9 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  31.9 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  32.7 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  32.69 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  32.65 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  32.65 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  31.15 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  31.31 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  31.31 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  32.65 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  31.43 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  32.52 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  32.52 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  29.76 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  31.76 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  33.02 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  35.09 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  35.09 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  29.8 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  35.29 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  32.86 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  29.8 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  29.8 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  31.65 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  28.89 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  31.12 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  31.42 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  31.36 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  29.1 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  30.83 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  29.72 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  30.9 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  31.03 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0068  hypothetical protein  27.08 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  29.84 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  28.51 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  27.1 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  35.76 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  29.27 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  27.92 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  34.65 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  27.53 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  30.54 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  35.4 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  32.58 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  32.57 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  29.65 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  28.46 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  38.38 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4825  hypothetical protein  31.69 
 
 		 195 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  31.76 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  30.22 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  28.47 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  32.74 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  32.75 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  27.64 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1754  hypothetical protein  24.75 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  31.53 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  33.64 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  31.21 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  32.12 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  32.3 
 
 		 2016 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  28.73 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  34.19 
 
 		 1803 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  35.09 
 
 		 1959 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  38.3 
 
 		 2002 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  31.71 
 
 		 2222 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  27.37 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  28.49 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  35.23 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  34.68 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  34.91 
 
 		 1983 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4824  hypothetical protein  36.11 
 
 		 109 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  30 
 
 		 2197 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  29.96 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1823 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  29.17 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  27.78 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1533  hypothetical protein  21.91 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.837222  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  27.71 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  31.62 
 
 		 2198 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  27.03 
 
 		 1754 aa  45.8  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  27.42 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>