240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3572 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 349 aa  689    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  55.34 
 
 		 356 aa  348  8e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.07 
 
 		 356 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  55.07 
 
 		 356 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  53.61 
 
 		 367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  53.39 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  49.73 
 
 		 376 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  51.33 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  49.59 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  50.73 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  50.61 
 
 		 343 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  51.03 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  49.84 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  48.73 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.95 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  46.98 
 
 		 328 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  45.45 
 
 		 352 aa  249  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.51 
 
 		 369 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.13 
 
 		 409 aa  235  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  44.19 
 
 		 389 aa  235  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.21 
 
 		 360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.4 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  44.78 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  45.17 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  44.71 
 
 		 335 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  43.92 
 
 		 369 aa  222  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  41.84 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  43.54 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  43.6 
 
 		 379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.44 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  43.49 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.43 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.83 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  38.06 
 
 		 398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  40.31 
 
 		 386 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  35.91 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  31.31 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  27.33 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  30.5 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  31.1 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  29.79 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.87 
 
 		 328 aa  86.3  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  27.91 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.94 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  29.08 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  30.22 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  25.88 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.02 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.05 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  26.62 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  25.51 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  31.3 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  25.51 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  31.15 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.67 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.28 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  27.21 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1533  folate-binding protein YgfZ  29.19 
 
 		 291 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  27.4 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.2 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.64 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2505  folate-binding protein YgfZ  26.35 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438476  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.42 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  28.74 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.57 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2622  glycine cleavage T-protein barrel  27.31 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  26.14 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  25.23 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00606  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  29.33 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.42 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  25.32 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.01 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  26.76 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1427  folate-binding protein YgfZ  25.66 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345601  normal  0.255059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.08 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.16 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.38 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  27.66 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.62 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  27.66 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1462  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  37.04 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  22.46 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  26.91 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1468  folate-binding protein YgfZ  25.94 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606747  normal  0.0230828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0500  glycine cleavage system T protein  24.67 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  26.46 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  25.1 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  24.58 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  32.41 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  27.34 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.76 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  32.46 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.56 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0667  aminomethyltransferase, putative  24.66 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0660  folate-binding protein YgfZ  24.66 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.439221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0860  folate-binding protein YgfZ  24.39 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>