169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3555 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  100 
 
 		 284 aa  549  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  38.38 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  36.75 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38340  sugar kinase, ribokinase  41.79 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  33.1 
 
 		 288 aa  166  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  30.96 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  30.96 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  33.8 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0378  PfkB domain protein  43.84 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  44.23 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2097  PfkB domain protein  46.13 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0568706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1248  PfkB domain protein  38.85 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000612898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6930  PfkB domain protein  38.11 
 
 		 313 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  41.16 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  35.11 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  32.87 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  32.87 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  32.87 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  32.53 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  32.87 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  32.32 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  37.11 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  31.99 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  37.26 
 
 		 453 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  31.65 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  31.65 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  31.65 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  31.65 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  34.03 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  30.53 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  29.69 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  30.72 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  32.76 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  30.94 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  27.17 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  28.72 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  34.81 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  30.94 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  32.87 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  29.27 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  36.24 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  29.48 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  29.41 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  31.23 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  31.16 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  26.98 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  31.1 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  28.63 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  27.24 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  27.4 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  28.46 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  24.73 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.27 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  28.63 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  29.45 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  30.56 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  28.25 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  25.27 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  32.34 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  24.44 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  28.15 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  30.21 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  28.21 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  28.47 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  27.5 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  25.46 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  27.55 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  20.69 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.88 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  28.09 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  25.09 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  24.72 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  25.09 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  22.38 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  27.13 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  25.27 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  22.73 
 
 		 403 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  23.43 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  26.18 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  29.12 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  20.75 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  24.35 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  25.1 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0652  PfkB domain-containing protein  29.63 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  22.43 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  26.71 
 
 		 327 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  22.65 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  25.35 
 
 		 339 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  27.11 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  26.71 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  25.62 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.51 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36053  predicted protein  28.12 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.630596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  26.72 
 
 		 420 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  24.21 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>