132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3510 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 172 aa  323  5e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  47.2 
 
 		 197 aa  95.5  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  41.94 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  38.21 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  45.38 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  40.46 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  40.46 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  41.59 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  45.45 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  30.77 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  40.54 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  46.94 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  35.92 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  43.48 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  38.6 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  43.1 
 
 		 560 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  38.52 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  39.67 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  42.27 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  38.03 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  36.96 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  39 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  36.27 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  41.41 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 869 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  38.41 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  38.6 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  33.88 
 
 		 544 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  33.88 
 
 		 544 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  32.81 
 
 		 547 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  37.68 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.71 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  33.88 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  32.79 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  32.23 
 
 		 547 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  36.26 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  36.51 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  32.54 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  32.54 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  32.54 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  32.54 
 
 		 549 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  32.54 
 
 		 544 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  32.03 
 
 		 588 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  43.12 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  32.54 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  32.54 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  32.23 
 
 		 544 aa  54.3  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  32.54 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.04 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  32.54 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  36.51 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 513 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  31.5 
 
 		 127 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  32.26 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  32.41 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  32.54 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  36.07 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  38.14 
 
 		 519 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  32.41 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  32.41 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.79 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 272 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 		 546 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  31.48 
 
 		 124 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  31.4 
 
 		 549 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 126 aa  50.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 		 189 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  31.11 
 
 		 571 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  35.25 
 
 		 565 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.25 
 
 		 564 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 		 590 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  33.05 
 
 		 203 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  27.93 
 
 		 120 aa  48.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  38.26 
 
 		 119 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 424 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  34.65 
 
 		 576 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 613 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  34.59 
 
 		 512 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  35.43 
 
 		 124 aa  45.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 125 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  34.91 
 
 		 124 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 120 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1207  copper resistance protein CopC  29.27 
 
 		 121 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  33.02 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>