283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3427 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  100 
 
 		 76 aa  151  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  73.24 
 
 		 77 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  73.24 
 
 		 77 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  73.24 
 
 		 77 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  73.24 
 
 		 77 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  74.29 
 
 		 80 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  71.83 
 
 		 77 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  71.23 
 
 		 77 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  73.91 
 
 		 83 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  71.83 
 
 		 77 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  71.83 
 
 		 83 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  71.64 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  70.42 
 
 		 77 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  66.2 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  70.97 
 
 		 85 aa  93.6  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6606  ribosomal protein L29  80.39 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  59.76 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  63.89 
 
 		 80 aa  89.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  64.18 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  61.76 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  68.85 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  67.74 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  56 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  61.97 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  58.82 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  64.06 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4307  50S ribosomal protein L29  72.22 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243874  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3915  50S ribosomal protein L29  72.22 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  62.69 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  54.17 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  58.46 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  63.08 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  60.29 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  64.41 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  59.7 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  64.71 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  66.67 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0595  ribosomal protein L29  65.45 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  62.9 
 
 		 69 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  61.9 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  57.81 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  61.54 
 
 		 71 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  57.38 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 64 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  57.38 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  61.02 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  60.66 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 69 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  55 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  53.33 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  58.73 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  52.46 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  56.9 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  53.45 
 
 		 66 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  56.25 
 
 		 66 aa  66.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  54.41 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  51.72 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  55 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  57.41 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  55.17 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  49.28 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  49.28 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  49.28 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  55.17 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  51.72 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  54.39 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>