More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3398 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  85.62 
 
 		 146 aa  250  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  75.34 
 
 		 146 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  77.78 
 
 		 148 aa  227  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  76.55 
 
 		 149 aa  226  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  76.55 
 
 		 149 aa  226  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  76.55 
 
 		 149 aa  226  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  77.08 
 
 		 147 aa  223  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  73.47 
 
 		 147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  73.43 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  74.48 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  71.13 
 
 		 152 aa  208  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  69.01 
 
 		 158 aa  203  8e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  71.13 
 
 		 152 aa  202  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  70.55 
 
 		 148 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  67.83 
 
 		 210 aa  197  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  69.23 
 
 		 163 aa  197  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  68.75 
 
 		 146 aa  197  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  69.23 
 
 		 243 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  68.03 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  68.03 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  68.53 
 
 		 176 aa  192  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  69.01 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  67.35 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  67.36 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  64.58 
 
 		 177 aa  188  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  65.96 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  184  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  66.9 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  66.21 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  63.45 
 
 		 150 aa  177  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  62.76 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  58.74 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  62.07 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  59.31 
 
 		 151 aa  170  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  58.04 
 
 		 151 aa  169  9e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  59.31 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  62.59 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  52.05 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  45.1 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 		 152 aa  114  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  41.45 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  47.4 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  44.94 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  49.37 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 176 aa  110  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  43.15 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  48.1 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  49.01 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  39.31 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  41.26 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0611  50S ribosomal protein L15  44.87 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  47.2 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 146 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  51.66 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2600  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0101139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  46.15 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  41.38 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  44 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  46.15 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  39.07 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  46.05 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  43.67 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  40.82 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23280  LSU ribosomal protein L15P  52.35 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.332048  hitchhiker  0.00000574627 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  48.37 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2215  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>