More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3286 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  83.77 
 
 		 230 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  83.33 
 
 		 230 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  83.41 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  83.33 
 
 		 230 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  83.33 
 
 		 230 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  83.41 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  86.4 
 
 		 228 aa  356  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  83.41 
 
 		 229 aa  338  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.7 
 
 		 228 aa  333  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  72.81 
 
 		 227 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.24 
 
 		 229 aa  303  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  72 
 
 		 234 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.04 
 
 		 229 aa  284  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  61.67 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  62.39 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.82 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.44 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.46 
 
 		 238 aa  255  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.47 
 
 		 254 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.8 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  59.47 
 
 		 226 aa  241  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  57.85 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 224 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.88 
 
 		 223 aa  238  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  57.59 
 
 		 224 aa  238  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.19 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.57 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.35 
 
 		 223 aa  234  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  55.36 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 224 aa  230  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.16 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 		 273 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  50.89 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 406 aa  225  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.21 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  54.46 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  50 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.89 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 229 aa  221  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 235 aa  221  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 224 aa  221  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  50.88 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  51.11 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.79 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.33 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 223 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 244 aa  215  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  46.88 
 
 		 224 aa  214  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.74 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  50.67 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  53.57 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  50.22 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  47.09 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  51.9 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  49.33 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  50.95 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.36 
 
 		 239 aa  207  8e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  49.55 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  50.95 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  50.95 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  50.71 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  50.71 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  49.56 
 
 		 241 aa  205  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 242 aa  204  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>