More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3254 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  56.72 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  58.46 
 
 		 152 aa  156  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3658  AsnC family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0071  AsnC family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.84 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  49.22 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  46.09 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  50.86 
 
 		 150 aa  116  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  49.22 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  46.09 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  46.46 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  46.46 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  45.97 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  45.97 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  45.31 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 218 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  44.53 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  43.61 
 
 		 164 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.28 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  43.61 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  43.75 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  45.31 
 
 		 155 aa  106  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 174 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  42.11 
 
 		 162 aa  105  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  45.97 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  45.97 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  45.97 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 167 aa  104  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  41.41 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  44.53 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  43.41 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>