More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3248 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  61.43 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.49 
 
 		 226 aa  281  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  62.5 
 
 		 226 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.1 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  61.88 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  61.61 
 
 		 231 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.09 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  58.93 
 
 		 224 aa  271  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  60.27 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1879  two component transcriptional regulator  59.82 
 
 		 224 aa  264  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0517799  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  59.82 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  59.82 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  59.82 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3804  response regulator receiver protein  59.11 
 
 		 222 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  56 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1514  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.23375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1436  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.78 
 
 		 374 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235107  normal  0.196067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.11 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0437  response regulator receiver protein  58.22 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1633  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.56 
 
 		 254 aa  235  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6788  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.17 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.31 
 
 		 236 aa  234  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  0.282737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27020  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.5 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4329  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.077082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6795  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.22 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3288  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 272 aa  225  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3551  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 		 224 aa  218  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.375493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.44 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.66 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1020  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.22 
 
 		 226 aa  215  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00378459  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  48.87 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3284  two component transcriptional regulator  54.31 
 
 		 232 aa  214  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0682203  normal  0.363076 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.21 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.21 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  47.77 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  47.77 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.77 
 
 		 225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 236 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.77 
 
 		 225 aa  211  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.09 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.67 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.67 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.22 
 
 		 225 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 231 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  48.64 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.22 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  46.4 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 232 aa  205  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.78 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.51 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  48.18 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.89 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000603864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.89 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.89 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.09 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  46.15 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 232 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 230 aa  201  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  47.09 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  47.09 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.09 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  47.09 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  47.09 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  47.09 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  47.09 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  47.09 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  47.09 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  47.53 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>