More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3171 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  75.23 
 
 		 451 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 426 aa  869    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  79.46 
 
 		 446 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  76.4 
 
 		 442 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  75.93 
 
 		 446 aa  679    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  75.89 
 
 		 440 aa  664    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  79.46 
 
 		 446 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  79.46 
 
 		 446 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  70.28 
 
 		 434 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  70.14 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  69.16 
 
 		 441 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.03 
 
 		 449 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  69.58 
 
 		 438 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  67.69 
 
 		 441 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  68.87 
 
 		 440 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  69.32 
 
 		 445 aa  605  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  66.27 
 
 		 444 aa  598  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  66.67 
 
 		 443 aa  599  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  66.51 
 
 		 441 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  68.08 
 
 		 448 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  65.41 
 
 		 457 aa  584  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  66.43 
 
 		 483 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  65.65 
 
 		 482 aa  579  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  65.65 
 
 		 446 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  67.22 
 
 		 426 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  65.81 
 
 		 445 aa  565  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  65.19 
 
 		 450 aa  567  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  64.87 
 
 		 447 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  64.24 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  61.85 
 
 		 460 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  63.55 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.99 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.88 
 
 		 411 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.61 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.61 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.29 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.57 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.79 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.8 
 
 		 389 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.19 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.31 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.55 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  44.03 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.74 
 
 		 422 aa  363  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 		 393 aa  361  2e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.3 
 
 		 403 aa  360  3e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  44.75 
 
 		 388 aa  359  5e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  43.32 
 
 		 397 aa  355  6.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  43.75 
 
 		 416 aa  354  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.04 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  42.79 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.8 
 
 		 396 aa  350  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  43.26 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  43.26 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.79 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.11 
 
 		 415 aa  347  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.49 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  46.52 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.06 
 
 		 400 aa  345  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 392 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  42.41 
 
 		 475 aa  344  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.77 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.06 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  44.58 
 
 		 401 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  44 
 
 		 392 aa  342  9e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  45.3 
 
 		 396 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  46.27 
 
 		 396 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  41.36 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  42.52 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  44.78 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  41.36 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 416 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  44.06 
 
 		 396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  44.53 
 
 		 396 aa  338  8e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  42.29 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  44.83 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  44.33 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  40.14 
 
 		 417 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  40.89 
 
 		 417 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  44.09 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2247  NADH dehydrogenase subunit D  43.75 
 
 		 412 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0299939  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  40.19 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  41.67 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  43.81 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  42 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.27 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0891  NADH dehydrogenase subunit D  44.53 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.984899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  42.89 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  41.53 
 
 		 402 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.65 
 
 		 417 aa  332  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  42.72 
 
 		 416 aa  332  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  42.14 
 
 		 403 aa  332  8e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 		 417 aa  332  8e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  39.66 
 
 		 474 aa  332  9e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  332  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1358  NADH dehydrogenase subunit D  43.1 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121379  normal  0.0313197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>