156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3142 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  57.27 
 
 		 667 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  62.86 
 
 		 696 aa  735    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  62.97 
 
 		 664 aa  756    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  100 
 
 		 656 aa  1311    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  62.97 
 
 		 664 aa  756    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  63.42 
 
 		 667 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  62.67 
 
 		 664 aa  749    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2052  hypothetical protein  60 
 
 		 673 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299125  normal  0.344575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  61.85 
 
 		 673 aa  732    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  57.36 
 
 		 665 aa  636    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  54.51 
 
 		 665 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  54.99 
 
 		 662 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  52.41 
 
 		 652 aa  591  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  51.51 
 
 		 682 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  54.94 
 
 		 657 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  50.83 
 
 		 710 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  52.24 
 
 		 673 aa  559  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  51.16 
 
 		 677 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  47.4 
 
 		 699 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  51.4 
 
 		 669 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  53.84 
 
 		 682 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  47.68 
 
 		 699 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3705  protein of unknown function DUF255  52.87 
 
 		 703 aa  538  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164339  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1103  protein of unknown function DUF255  51.76 
 
 		 687 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.491204  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  48.33 
 
 		 658 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  52.91 
 
 		 596 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  45.44 
 
 		 696 aa  499  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  46 
 
 		 685 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  44.27 
 
 		 700 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  45.41 
 
 		 666 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  40.76 
 
 		 681 aa  465  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  43.62 
 
 		 693 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  38.57 
 
 		 690 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  35.59 
 
 		 686 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  38.28 
 
 		 686 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  44.35 
 
 		 756 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  38.69 
 
 		 699 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  36.76 
 
 		 686 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  41.48 
 
 		 681 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  42.77 
 
 		 678 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  39.21 
 
 		 733 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  41.9 
 
 		 682 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  37.46 
 
 		 684 aa  412  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  36.85 
 
 		 673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  35.87 
 
 		 680 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  39.91 
 
 		 676 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  40.8 
 
 		 665 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  35.11 
 
 		 675 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  39.71 
 
 		 694 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  37.78 
 
 		 715 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  35.65 
 
 		 711 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  38.47 
 
 		 707 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  38.78 
 
 		 722 aa  402  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  41.69 
 
 		 673 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  38.59 
 
 		 700 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  41.13 
 
 		 697 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  37.99 
 
 		 669 aa  396  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  39.23 
 
 		 676 aa  395  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  35.92 
 
 		 681 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  38.95 
 
 		 717 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  36.22 
 
 		 680 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  38.15 
 
 		 744 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  38.1 
 
 		 700 aa  392  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  40.53 
 
 		 677 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  35.91 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  39.85 
 
 		 672 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  38.36 
 
 		 723 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  36.22 
 
 		 711 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  40.12 
 
 		 706 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  33.24 
 
 		 703 aa  383  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  39.18 
 
 		 666 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  37 
 
 		 676 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  39.1 
 
 		 725 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  41.31 
 
 		 669 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  39.04 
 
 		 666 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  37.14 
 
 		 715 aa  377  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  37.37 
 
 		 699 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  39.74 
 
 		 676 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  33.28 
 
 		 691 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  44.1 
 
 		 718 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  34.56 
 
 		 670 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  35.36 
 
 		 756 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  39.97 
 
 		 679 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  37.96 
 
 		 676 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  37.09 
 
 		 746 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  37.09 
 
 		 720 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  35.18 
 
 		 721 aa  362  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  44.55 
 
 		 718 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  32.7 
 
 		 681 aa  360  5e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  39.8 
 
 		 680 aa  360  6e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  40.26 
 
 		 718 aa  359  9e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  34.09 
 
 		 712 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  35.24 
 
 		 751 aa  357  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2409  hypothetical protein  43.47 
 
 		 743 aa  356  6.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  36.54 
 
 		 700 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  36.95 
 
 		 750 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  37.39 
 
 		 660 aa  356  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  36.34 
 
 		 706 aa  355  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  37.81 
 
 		 714 aa  355  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  35.45 
 
 		 737 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>