224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3088 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
144 aa  283  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  46.27 
 
 
169 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 
199 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  47.97 
 
 
186 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  5.47755e-05 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 
193 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 
143 aa  77  8e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0927  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 
176 aa  70.9  5e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
244 aa  70.1  1e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
194 aa  69.7  1e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  34.92 
 
 
169 aa  62.8  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 
164 aa  62  3e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  34.43 
 
 
145 aa  60.8  5e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  40.43 
 
 
287 aa  59.7  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
149 aa  58.9  2e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
303 aa  58.9  3e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  42.47 
 
 
292 aa  55.1  3e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
164 aa  55.1  4e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 
156 aa  54.3  6e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
151 aa  54.3  6e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
150 aa  54.3  6e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  53.5  9e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
156 aa  52.8  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 
140 aa  52.8  1e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.44 
 
 
151 aa  53.5  1e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
142 aa  53.1  1e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
142 aa  53.1  1e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
156 aa  52.8  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  37.76 
 
 
152 aa  52.4  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
142 aa  51.6  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 
171 aa  51.6  3e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  45.78 
 
 
158 aa  52  3e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 
158 aa  50.8  5e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
142 aa  51.2  5e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
156 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
142 aa  50.8  6e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 
171 aa  50.8  6e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
157 aa  50.1  1e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
314 aa  49.7  1e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 
175 aa  50.1  1e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 
140 aa  49.3  2e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
154 aa  48.9  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
147 aa  48.5  3e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 
172 aa  48.5  3e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
167 aa  48.1  4e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 
147 aa  48.1  4e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 
151 aa  48.1  4e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  47.54 
 
 
146 aa  48.1  4e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 
149 aa  48.1  4e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 
147 aa  48.1  4e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  40.45 
 
 
159 aa  48.1  4e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
141 aa  48.1  4e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
162 aa  47.8  5e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
161 aa  47.4  6e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
161 aa  47.8  6e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 
186 aa  47.8  6e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  38.55 
 
 
159 aa  47.8  6e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
172 aa  47.4  6e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
167 aa  47.4  6e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
164 aa  47.4  7e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
136 aa  47.4  7e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 
176 aa  47  8e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
137 aa  47  8e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  41.33 
 
 
178 aa  47.4  8e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
171 aa  47  9e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  42.17 
 
 
160 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  47.27 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
169 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  32 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  44.64 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  31.63 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  37.66 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.72 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  8.13466e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  42.42 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  3.88035e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
195 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>