280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3087 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
230 aa  464  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  51.33 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  47.64 
 
 
250 aa  215  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  47.35 
 
 
227 aa  203  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.37 
 
 
227 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  45.18 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  44.74 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  46.46 
 
 
273 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.54 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  44.05 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  44.69 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.69 
 
 
228 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  44.39 
 
 
229 aa  194  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  44.3 
 
 
227 aa  194  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  44.3 
 
 
227 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  44.3 
 
 
227 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  41.85 
 
 
232 aa  193  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  48.67 
 
 
267 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  43.23 
 
 
235 aa  191  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.86 
 
 
231 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  45.37 
 
 
260 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.37 
 
 
260 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  46.49 
 
 
227 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.13 
 
 
232 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  44 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  46.02 
 
 
228 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.01 
 
 
249 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48 
 
 
227 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.383076 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  40.97 
 
 
230 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  40.53 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  46.02 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  42.67 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  41.67 
 
 
223 aa  170  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  37.77 
 
 
221 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  40.27 
 
 
230 aa  167  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.76 
 
 
242 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  39.74 
 
 
230 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  37.5 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.3 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.3 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  43.46 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  42.11 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  37.99 
 
 
257 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.67 
 
 
227 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.86 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0152  ThiJ/PfpI domain protein  41.3 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2524  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.28 
 
 
234 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  38.16 
 
 
245 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  41.59 
 
 
225 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.91 
 
 
232 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.67 
 
 
224 aa  158  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.04 
 
 
229 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  37.61 
 
 
226 aa  156  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.4 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  39.21 
 
 
229 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  36.89 
 
 
267 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.33 
 
 
230 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  38.26 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.15 
 
 
224 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  42.11 
 
 
224 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  40.53 
 
 
230 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.78 
 
 
237 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.78 
 
 
237 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.81 
 
 
229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.74 
 
 
231 aa  151  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.33 
 
 
225 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  38.22 
 
 
227 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.39 
 
 
225 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  39.74 
 
 
231 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.5 
 
 
225 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  37.55 
 
 
226 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  38.77 
 
 
227 aa  148  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.47 
 
 
258 aa  148  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  38.5 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.82 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.39 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  39.65 
 
 
227 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  38.6 
 
 
261 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  38.67 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  38.16 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.5 
 
 
231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0629  thiJ/pfpI family protein  43.95 
 
 
166 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2762  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  38.96 
 
 
228 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  38.39 
 
 
223 aa  144  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.56 
 
 
228 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  38.05 
 
 
226 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.96 
 
 
228 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  38.05 
 
 
226 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  38.05 
 
 
226 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  38.05 
 
 
226 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  38.1 
 
 
224 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  36.73 
 
 
225 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  38.05 
 
 
226 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  37.44 
 
 
226 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  38.05 
 
 
226 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  38.05 
 
 
226 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  33.04 
 
 
219 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  34.36 
 
 
224 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  38.16 
 
 
226 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.23 
 
 
238 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>