218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3065 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 276 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 313 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  41.11 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  41.26 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  41.54 
 
 		 287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  43.02 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  41.73 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  41.35 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  39.26 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  38.52 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  40.73 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  31.48 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  39.63 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  39.26 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  40.95 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  39.45 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  36.54 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  38.87 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  42.25 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  37.72 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  35.69 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  35.69 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  38.7 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  39.18 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  35.86 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  36.92 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  35.57 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  35.66 
 
 		 258 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  37.6 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  37.9 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  36.48 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  38.43 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  38.34 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  37.27 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  34.26 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  38.11 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0025  helix-turn-helix domain protein  35.61 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  33.08 
 
 		 314 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  33.07 
 
 		 282 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  36.97 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  34.87 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  35.69 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  34.3 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  39.84 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 279 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  37.92 
 
 		 279 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  37.84 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  35.95 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  34.36 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  34.4 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  35.52 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  33.83 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5476  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  35.41 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  36.13 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  35.85 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  32.68 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  34.72 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>