More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3055 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 532 aa  999    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.91 
 
 		 540 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.07 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.62 
 
 		 547 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  46.92 
 
 		 547 aa  362  7.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  47.64 
 
 		 592 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 		 572 aa  347  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.32 
 
 		 569 aa  340  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.42 
 
 		 544 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  47.33 
 
 		 551 aa  329  6e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  44.1 
 
 		 576 aa  324  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 		 601 aa  299  9e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 		 564 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 		 634 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 		 663 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 		 509 aa  176  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 		 606 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 		 565 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 		 597 aa  160  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 		 550 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.4 
 
 		 510 aa  153  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.44 
 
 		 515 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 		 528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.06 
 
 		 543 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.95 
 
 		 545 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.36 
 
 		 569 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.73 
 
 		 569 aa  113  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  25.11 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.81 
 
 		 545 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  27.35 
 
 		 535 aa  110  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  27.04 
 
 		 560 aa  109  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  27.96 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  27.89 
 
 		 523 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  25.05 
 
 		 568 aa  104  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  23.25 
 
 		 514 aa  103  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  23.28 
 
 		 509 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  25.89 
 
 		 535 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  25.89 
 
 		 535 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  29.88 
 
 		 545 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  30.92 
 
 		 555 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  26.12 
 
 		 536 aa  99.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  27.59 
 
 		 536 aa  100  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.3 
 
 		 551 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  25.67 
 
 		 535 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  26.29 
 
 		 536 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  25.48 
 
 		 536 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  26.29 
 
 		 536 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  28.85 
 
 		 531 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  26.12 
 
 		 536 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  25.85 
 
 		 541 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  26.74 
 
 		 536 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  26.74 
 
 		 536 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  24.85 
 
 		 534 aa  97.4  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 		 740 aa  97.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  26.12 
 
 		 536 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 		 518 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  25.21 
 
 		 536 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3698  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  32.69 
 
 		 285 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.2 
 
 		 551 aa  94  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  26.56 
 
 		 536 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  27.1 
 
 		 521 aa  94  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  26.56 
 
 		 536 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  32.02 
 
 		 264 aa  93.6  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 		 264 aa  93.6  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 		 742 aa  93.6  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1307  iron ABC transporter permease  26.49 
 
 		 578 aa  93.2  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  26.34 
 
 		 536 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.61 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  26.34 
 
 		 536 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2779  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.68 
 
 		 263 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  26.34 
 
 		 536 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3433  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.21 
 
 		 285 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.36 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.24 
 
 		 586 aa  90.5  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.93 
 
 		 585 aa  90.1  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  36.24 
 
 		 542 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.91 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  26.95 
 
 		 535 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 741 aa  87.8  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  24.65 
 
 		 552 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  23.88 
 
 		 530 aa  87.4  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.24 
 
 		 741 aa  87.8  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.7 
 
 		 677 aa  87.4  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.82 
 
 		 561 aa  87.4  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  24.65 
 
 		 545 aa  87  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.51 
 
 		 585 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  24.65 
 
 		 583 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.79 
 
 		 273 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.51 
 
 		 585 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.57 
 
 		 758 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.51 
 
 		 585 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  24.67 
 
 		 516 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 741 aa  86.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 		 579 aa  85.9  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.84 
 
 		 275 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.89 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  24.23 
 
 		 583 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  24.65 
 
 		 583 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.69 
 
 		 603 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>