131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3052 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  85.71 
 
 
408 aa  653    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  84.41 
 
 
404 aa  656    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  85.68 
 
 
405 aa  700    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  87.28 
 
 
404 aa  703    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  93.83 
 
 
405 aa  749    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  100 
 
 
403 aa  803    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  65.23 
 
 
410 aa  504  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  47.88 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  47.88 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  46.59 
 
 
436 aa  282  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  48.84 
 
 
424 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  44.19 
 
 
434 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  44.73 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  46.15 
 
 
430 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  43.93 
 
 
434 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  43.93 
 
 
434 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  43.15 
 
 
426 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  45.1 
 
 
430 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  47.29 
 
 
411 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  47.29 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  47.29 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  45.01 
 
 
426 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  43.44 
 
 
466 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  40.09 
 
 
547 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  39.67 
 
 
474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  40.56 
 
 
457 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  38.86 
 
 
479 aa  226  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  51.97 
 
 
268 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  36.59 
 
 
481 aa  210  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  40.52 
 
 
423 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  40.9 
 
 
441 aa  206  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  36.59 
 
 
437 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  44.44 
 
 
256 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  32.32 
 
 
555 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  38.3 
 
 
340 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  31.52 
 
 
589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  31.39 
 
 
541 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  29.95 
 
 
494 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  43.15 
 
 
594 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  30.54 
 
 
545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.07 
 
 
580 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  28.23 
 
 
535 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  29.21 
 
 
567 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  27.57 
 
 
499 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.69 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  29.41 
 
 
508 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28 
 
 
568 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.61 
 
 
556 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  26.4 
 
 
551 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  26.56 
 
 
620 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  24.87 
 
 
530 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.32 
 
 
566 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  32.22 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  31.15 
 
 
510 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  23.97 
 
 
585 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  31.14 
 
 
584 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  30.59 
 
 
558 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  29.39 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  31.48 
 
 
580 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.48 
 
 
516 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  34.06 
 
 
628 aa  63.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.75 
 
 
443 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  32.67 
 
 
605 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  25.28 
 
 
507 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  24.93 
 
 
512 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  26.4 
 
 
480 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  26.4 
 
 
480 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.4 
 
 
480 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  26.29 
 
 
511 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  26.29 
 
 
488 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  33.12 
 
 
714 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  31.79 
 
 
602 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  26.46 
 
 
498 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  29.79 
 
 
603 aa  50.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  34.48 
 
 
586 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  29.18 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  25.2 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  27.07 
 
 
475 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  25 
 
 
502 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  25 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  23.89 
 
 
567 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  25.44 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  50 
 
 
199 aa  47.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  39.24 
 
 
418 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  24.03 
 
 
473 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  39.19 
 
 
177 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  39.19 
 
 
177 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  32.66 
 
 
485 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  31.58 
 
 
546 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  36.26 
 
 
582 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  35.06 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  39.74 
 
 
169 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  32.12 
 
 
561 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  32.12 
 
 
577 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  35.14 
 
 
171 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  31.58 
 
 
561 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  42.37 
 
 
221 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  25.12 
 
 
506 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  35.14 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  23.22 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>