More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2986 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  61.07 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  57.72 
 
 		 168 aa  146  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  50.77 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  54.29 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  55.15 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  56.52 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  54.35 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  54.63 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  50.88 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  44.53 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  51.89 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  45.8 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  49.53 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  48.28 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  49.57 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  43.8 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.5 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  49.06 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  52.34 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  50.49 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.38 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  43.1 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  45.13 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  40.14 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  56.32 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  49.5 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  51.49 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  42.28 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  42.2 
 
 		 291 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  41.67 
 
 		 291 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 309 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 291 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 286 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 322 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 322 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  37.19 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 		 250 aa  84.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  38.41 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 513 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 281 aa  84  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 292 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  40.32 
 
 		 176 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2175  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  39.8 
 
 		 331 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 346 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  41.58 
 
 		 297 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 296 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  47.13 
 
 		 255 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  41.07 
 
 		 303 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 293 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 		 265 aa  80.5  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 		 305 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 		 305 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 304 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  42.71 
 
 		 262 aa  77.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  40.4 
 
 		 261 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  39.09 
 
 		 324 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 315 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 315 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 315 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.86 
 
 		 250 aa  77.4  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 291 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  42.11 
 
 		 315 aa  77.4  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 296 aa  77  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 293 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>