More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2962 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
397 aa  798    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  57.8 
 
 
395 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  56.3 
 
 
388 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  50.26 
 
 
385 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  50.89 
 
 
392 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  47.16 
 
 
384 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  42.22 
 
 
410 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.51 
 
 
404 aa  160  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  35.4 
 
 
382 aa  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.51 
 
 
406 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  30.47 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 
410 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  31.82 
 
 
382 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  27.27 
 
 
374 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.86 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.27 
 
 
404 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.29 
 
 
404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.7 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  29.86 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  29.86 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  32.86 
 
 
385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  28.93 
 
 
390 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.81 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  31.52 
 
 
382 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  29.58 
 
 
392 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  30.03 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  29.73 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  30.03 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  32.36 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.74 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.75 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  30.97 
 
 
382 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  30.97 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  29.65 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  30.24 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  30.85 
 
 
388 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  31.04 
 
 
388 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.32 
 
 
377 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
376 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  27.98 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  27.98 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.78 
 
 
405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  29.83 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  31.94 
 
 
393 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  31.36 
 
 
371 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  31.44 
 
 
385 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  31.44 
 
 
385 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  30.11 
 
 
557 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.89 
 
 
407 aa  123  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  31.23 
 
 
395 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 
387 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  31.16 
 
 
385 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  26.63 
 
 
429 aa  122  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  32.34 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  30.68 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.02 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  29.43 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.48 
 
 
397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.05 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  31.71 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.92 
 
 
391 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.51 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.21 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.32 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  29.19 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  28.61 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  30.54 
 
 
408 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  31.15 
 
 
393 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.59 
 
 
369 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  25.3 
 
 
377 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.45 
 
 
377 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  28.45 
 
 
402 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 
412 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.74 
 
 
385 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  31.01 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  27.48 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  28.31 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  29.19 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  27.67 
 
 
386 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.94 
 
 
386 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  30.31 
 
 
395 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 
400 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  32.76 
 
 
377 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.78 
 
 
376 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56488  precursor of protein zeaxanthin epoxidase-like protein  27.1 
 
 
604 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.97 
 
 
378 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  29.65 
 
 
391 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  29.65 
 
 
391 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  29.7 
 
 
416 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.6 
 
 
414 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  29.1 
 
 
399 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.46 
 
 
374 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.18 
 
 
376 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  29.38 
 
 
390 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  27.35 
 
 
373 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  26.55 
 
 
383 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  28.94 
 
 
381 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>