More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2940 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
421 aa  817    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  72.59 
 
 
414 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  65.51 
 
 
409 aa  487  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  62.94 
 
 
409 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  67.09 
 
 
406 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  64.71 
 
 
410 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  65.26 
 
 
419 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  64.69 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  64.69 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  64.69 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  60.05 
 
 
380 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  53.96 
 
 
407 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  52.99 
 
 
406 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  51.58 
 
 
419 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  54.83 
 
 
420 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  55.01 
 
 
419 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  52.75 
 
 
403 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  61.97 
 
 
306 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  61.97 
 
 
306 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  53.32 
 
 
429 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  50.36 
 
 
432 aa  349  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  50.25 
 
 
410 aa  322  7e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  44.1 
 
 
411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  41.15 
 
 
405 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  39.95 
 
 
408 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  40.45 
 
 
412 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  40.39 
 
 
404 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  40.3 
 
 
406 aa  264  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  37.71 
 
 
410 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  55.19 
 
 
297 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  41.6 
 
 
404 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  41.08 
 
 
405 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.52 
 
 
404 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  40.98 
 
 
429 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  41.15 
 
 
418 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  38.69 
 
 
410 aa  259  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  40.1 
 
 
405 aa  259  8e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  40.83 
 
 
405 aa  259  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  40.69 
 
 
418 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  40.3 
 
 
404 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  39.39 
 
 
398 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  41.06 
 
 
415 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  38.31 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  38 
 
 
410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  39.8 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  39.8 
 
 
429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  39.75 
 
 
404 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  39.25 
 
 
404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  38.62 
 
 
398 aa  245  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  56.07 
 
 
297 aa  242  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  36.61 
 
 
413 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  39.15 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  40.25 
 
 
411 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  34.95 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  54.85 
 
 
223 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  56.86 
 
 
216 aa  203  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  55.83 
 
 
234 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2319  phosphoserine phosphatase SerB  58.94 
 
 
213 aa  192  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  51.26 
 
 
278 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  49.35 
 
 
279 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  47.41 
 
 
284 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  48.29 
 
 
279 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  51.96 
 
 
240 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  46.44 
 
 
281 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  46.6 
 
 
215 aa  186  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  46.98 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  46.86 
 
 
279 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.9 
 
 
400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 
400 aa  184  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  48.77 
 
 
213 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  47.19 
 
 
281 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  50.5 
 
 
279 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  42.44 
 
 
302 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
348 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15880  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 
225 aa  180  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0152632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  47.8 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  45.89 
 
 
281 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  42.16 
 
 
285 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 
316 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 
316 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  45.3 
 
 
454 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  47.44 
 
 
299 aa  176  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  45.02 
 
 
281 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  46.57 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  46.15 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 
326 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0625  phosphoserine phosphatase SerB  42.65 
 
 
213 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0155366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>