48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2908 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  100 
 
 		 335 aa  649    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  44.27 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.51 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.16 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.34 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  44.62 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.34 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  42.41 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  42.64 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  41.03 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.93 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  40.43 
 
 		 335 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  38.34 
 
 		 342 aa  185  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  39.05 
 
 		 370 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  39.62 
 
 		 362 aa  179  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  39.64 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  41.94 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  41.14 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  39.49 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  36.9 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  39.76 
 
 		 335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  34.67 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  35.53 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  36.96 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  37.79 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  34.88 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  32.97 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  34.01 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  30.77 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  39.44 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  37.14 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  27.59 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  28.17 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  27.55 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  30.5 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  27.03 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  24.93 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  23.84 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  26.01 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  23.96 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  34.06 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  23.57 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  25.68 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  23.64 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  23.4 
 
 		 357 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  22.95 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1388  methionine synthase  22.47 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.53519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>