37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2825 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  55.64 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  56.58 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  56.58 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  56.58 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  52.14 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  53.51 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  52.63 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  52.1 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  55.36 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  49.22 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  53.05 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  50.44 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  50.44 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  50.44 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  49.58 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  45.76 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  48.03 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  48.48 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  46.44 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  43.97 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  52.14 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  44.54 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  45.28 
 
 		 270 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  38.76 
 
 		 306 aa  161  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  37.5 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  40.79 
 
 		 264 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  37.29 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  38.77 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  38.43 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  30.47 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  29.37 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  32.33 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  27.67 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6362  hypothetical protein  29.35 
 
 		 416 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  26.42 
 
 		 272 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  26.88 
 
 		 225 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>