More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2806 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 234 aa  455  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  68.04 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  68.04 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  68.04 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  70.75 
 
 		 220 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  64.52 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  66.51 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  64.68 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  53.92 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  51.22 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  48.78 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  44.06 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  39.62 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  43 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  41.95 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  44.09 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  40.86 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  41.26 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  40.87 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  42.58 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  47.2 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  35.94 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.88 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  40.31 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  38.02 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 		 213 aa  98.2  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  41.28 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  42.14 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  44.65 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.21 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 		 195 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.2 
 
 		 382 aa  95.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  41.28 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.7 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  38.33 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.14 
 
 		 369 aa  92  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  39.5 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  45.67 
 
 		 440 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 370 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 448 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.01 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 200 aa  89.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  34.44 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  40.7 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  40.57 
 
 		 251 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  44.3 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.19 
 
 		 442 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.52 
 
 		 356 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  43.64 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 412 aa  85.5  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 201 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  32.81 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  39.75 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  27.52 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  42.26 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  41.83 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>