More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2739 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  58.29 
 
 
629 aa  734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  63.21 
 
 
640 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  100 
 
 
641 aa  1308    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  70.85 
 
 
639 aa  884    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  63.81 
 
 
639 aa  807    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  63.21 
 
 
640 aa  762    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  63.57 
 
 
647 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  59.26 
 
 
657 aa  750    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  63.21 
 
 
640 aa  762    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  63.82 
 
 
649 aa  792    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  52.04 
 
 
629 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  52.95 
 
 
645 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  51.01 
 
 
632 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  50 
 
 
648 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  54.49 
 
 
628 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  50.39 
 
 
634 aa  600  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  50.9 
 
 
656 aa  595  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  49.48 
 
 
667 aa  592  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  49.15 
 
 
624 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  49.39 
 
 
651 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  48.83 
 
 
616 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  51.71 
 
 
616 aa  585  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  51.67 
 
 
655 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  50 
 
 
627 aa  578  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  47.3 
 
 
656 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  47.26 
 
 
658 aa  560  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  49.45 
 
 
636 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  49.14 
 
 
628 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  46.08 
 
 
623 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  48.77 
 
 
642 aa  549  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  46.81 
 
 
644 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  46.83 
 
 
629 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  45.58 
 
 
629 aa  512  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  45.36 
 
 
652 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  39.33 
 
 
699 aa  472  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  37.88 
 
 
718 aa  464  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  50.91 
 
 
700 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  42.11 
 
 
932 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  39.57 
 
 
588 aa  297  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  30.02 
 
 
599 aa  293  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  38.78 
 
 
587 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  32.33 
 
 
600 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  31.7 
 
 
582 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  31.7 
 
 
583 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.94 
 
 
588 aa  280  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.34 
 
 
587 aa  280  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  40.84 
 
 
619 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.65 
 
 
584 aa  269  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  37.16 
 
 
626 aa  268  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.84 
 
 
595 aa  263  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.11 
 
 
598 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.11 
 
 
598 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  31.63 
 
 
604 aa  260  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  31.08 
 
 
571 aa  259  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.65 
 
 
598 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.65 
 
 
598 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.98 
 
 
601 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.65 
 
 
598 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  35.81 
 
 
581 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.65 
 
 
598 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.65 
 
 
598 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.48 
 
 
600 aa  258  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.12 
 
 
605 aa  258  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.65 
 
 
598 aa  257  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  37.68 
 
 
587 aa  257  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.03 
 
 
598 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  36.03 
 
 
618 aa  256  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  35.59 
 
 
581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  35.59 
 
 
581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  35.59 
 
 
581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  35.59 
 
 
581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  35.59 
 
 
581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  35.59 
 
 
581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  34.72 
 
 
614 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  34.71 
 
 
676 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.58 
 
 
598 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  27.59 
 
 
626 aa  253  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  35.37 
 
 
581 aa  253  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  32.38 
 
 
704 aa  252  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  35.37 
 
 
581 aa  253  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  37.62 
 
 
641 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  35.37 
 
 
581 aa  251  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  36.07 
 
 
579 aa  250  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  34.57 
 
 
581 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  34.57 
 
 
581 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  34.55 
 
 
582 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  34.57 
 
 
581 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  34.57 
 
 
581 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  34.55 
 
 
582 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  35.29 
 
 
584 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  34.55 
 
 
582 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  32.47 
 
 
632 aa  249  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.22 
 
 
663 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  34.89 
 
 
584 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  37.83 
 
 
647 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  36.07 
 
 
660 aa  248  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  35.46 
 
 
652 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  35.92 
 
 
642 aa  247  4e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  34.35 
 
 
581 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  34.47 
 
 
582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>