29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2709 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  55.65 
 
 		 253 aa  285  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  57.32 
 
 		 263 aa  282  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  52.21 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1263  hypothetical protein  44 
 
 		 295 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  47.74 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1347  hypothetical protein  46.09 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  40.57 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  34.01 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  29.14 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  28.08 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  40.74 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  37.36 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  31.87 
 
 		 153 aa  62  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  34.31 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  32.67 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  38.54 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  32.89 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  40.7 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  31.18 
 
 		 155 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  33.7 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  26.57 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  28.71 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  46.15 
 
 		 187 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  37.7 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  29.11 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  31.18 
 
 		 153 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  36.17 
 
 		 156 aa  42  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  28 
 
 		 143 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>