More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2688 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
283 aa  570  1e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  51.41 
 
 
321 aa  280  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  50.74 
 
 
289 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  51.3 
 
 
310 aa  268  6e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  51.3 
 
 
310 aa  268  6e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  51.3 
 
 
310 aa  268  6e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  52.03 
 
 
307 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  50.37 
 
 
287 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  50.18 
 
 
307 aa  266  3e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  50.55 
 
 
277 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  49.63 
 
 
306 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  49.26 
 
 
306 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  48.51 
 
 
280 aa  248  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  48.85 
 
 
281 aa  244  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  46.01 
 
 
311 aa  234  1e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  44.74 
 
 
281 aa  215  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  46.69 
 
 
267 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  39.16 
 
 
269 aa  182  4e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  40.61 
 
 
270 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  41 
 
 
270 aa  158  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  39.59 
 
 
279 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  38.35 
 
 
294 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  36.84 
 
 
294 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  38.35 
 
 
291 aa  148  1e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  34.44 
 
 
274 aa  147  2e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  37.97 
 
 
291 aa  147  2e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  38.13 
 
 
276 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  37.05 
 
 
278 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  35.77 
 
 
275 aa  141  2e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  36.3 
 
 
270 aa  139  5e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  41.54 
 
 
290 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  37.64 
 
 
274 aa  135  7e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  31.93 
 
 
293 aa  135  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  34.59 
 
 
277 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  36.74 
 
 
268 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  9.04095e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  35 
 
 
267 aa  129  4e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  35 
 
 
267 aa  129  4e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  34.94 
 
 
279 aa  129  7e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  40.34 
 
 
271 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  33.94 
 
 
271 aa  126  4e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  38.02 
 
 
274 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  38.02 
 
 
274 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  33.09 
 
 
276 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  36.7 
 
 
273 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 
279 aa  121  1e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  36.06 
 
 
295 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  32.03 
 
 
282 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  37.86 
 
 
283 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  36.56 
 
 
297 aa  117  2e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  39.62 
 
 
266 aa  116  4e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  30.11 
 
 
293 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  35.79 
 
 
289 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  34.31 
 
 
278 aa  112  7e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  37.75 
 
 
281 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  35.58 
 
 
289 aa  112  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  35.94 
 
 
289 aa  108  7e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  32.64 
 
 
286 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34 
 
 
280 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  37.64 
 
 
276 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  33.94 
 
 
275 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  32.57 
 
 
277 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  33.6 
 
 
280 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  33.6 
 
 
280 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  32.74 
 
 
274 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  33.94 
 
 
275 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.85 
 
 
280 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.85 
 
 
280 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.85 
 
 
280 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  35.98 
 
 
289 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  30.56 
 
 
295 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  33.7 
 
 
272 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.48 
 
 
280 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  32.59 
 
 
274 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  31.6 
 
 
275 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  32.78 
 
 
310 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  28.24 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  34.69 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  28.82 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  34.2 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  30.52 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7154  HpcH/HpaI aldolase  32.41 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  33.73 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  30.86 
 
 
282 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  33.73 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  33.73 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  33.73 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.15 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  34.15 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  34.15 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.15 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.15 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  34.15 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  28.03 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  34.15 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  30.74 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  31.39 
 
 
313 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  31.25 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  29.74 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  31.88 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  33.71 
 
 
312 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>