More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2683 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  100 
 
 
348 aa  697    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  49.06 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  40.68 
 
 
372 aa  225  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  40.4 
 
 
372 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  40.4 
 
 
372 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  39.61 
 
 
378 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  37.96 
 
 
378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  39.88 
 
 
348 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  40 
 
 
363 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  39.2 
 
 
393 aa  206  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  39.6 
 
 
348 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  39.31 
 
 
348 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
348 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  39.45 
 
 
370 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  40.06 
 
 
343 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  38.54 
 
 
361 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  38.54 
 
 
361 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  38.73 
 
 
363 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  38.24 
 
 
363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  36.77 
 
 
330 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.9 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  32.44 
 
 
340 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  36.01 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  31.96 
 
 
323 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  34.76 
 
 
335 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  29.54 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  35.37 
 
 
327 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.31 
 
 
321 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  30.52 
 
 
306 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  51.38 
 
 
232 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  30.18 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  57.14 
 
 
380 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.75 
 
 
235 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  53.21 
 
 
164 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  30.62 
 
 
333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  47.46 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  28.48 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  32.17 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  30.14 
 
 
334 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  31.07 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  48.18 
 
 
349 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  27.83 
 
 
350 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  50.86 
 
 
222 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  45.28 
 
 
227 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  30.15 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  49.57 
 
 
317 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  30.87 
 
 
394 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.22 
 
 
391 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  30.39 
 
 
333 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  30.56 
 
 
337 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  30.68 
 
 
345 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  27.89 
 
 
337 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  48.51 
 
 
162 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  46.85 
 
 
173 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  29.31 
 
 
323 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.48 
 
 
330 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  28.07 
 
 
373 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  28.05 
 
 
348 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.22 
 
 
398 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
265 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  28.53 
 
 
323 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  42.59 
 
 
432 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  42.34 
 
 
432 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  46.94 
 
 
315 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  47.32 
 
 
236 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.52 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  40 
 
 
417 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
293 aa  96.7  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  46.49 
 
 
285 aa  96.3  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
476 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  40.95 
 
 
459 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.45 
 
 
393 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  29.54 
 
 
375 aa  93.6  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
453 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  42.27 
 
 
491 aa  93.2  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  53.19 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  32.08 
 
 
388 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.96 
 
 
438 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  45.65 
 
 
400 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  43.64 
 
 
524 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  40.17 
 
 
535 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.88 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  41.96 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  38.68 
 
 
325 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  37.61 
 
 
150 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
150 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  30.64 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.37 
 
 
556 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  44.17 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  40.5 
 
 
392 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  39.8 
 
 
197 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
204 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  44.83 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  40.18 
 
 
501 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
859 aa  87.4  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  41.12 
 
 
267 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  47 
 
 
368 aa  87  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  44.83 
 
 
362 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>