109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2640 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2640  protein of unknown function DUF552  100 
 
 
222 aa  437  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.340811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2994  hypothetical protein  56.6 
 
 
224 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0342705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3517  hypothetical protein  58.08 
 
 
210 aa  181  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0721193  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3250  hypothetical protein  55.22 
 
 
220 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3312  hypothetical protein  55.22 
 
 
220 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3261  hypothetical protein  55.22 
 
 
220 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289859  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12177  hypothetical protein  57.02 
 
 
241 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.899747  normal  0.644491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3011  protein of unknown function DUF552  44.78 
 
 
255 aa  168  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27340  hypothetical protein  43.8 
 
 
210 aa  141  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1116  hypothetical protein  70.33 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2921  protein of unknown function DUF552  68.13 
 
 
177 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00244461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0903  protein of unknown function DUF552  69.23 
 
 
172 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10359  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6101  protein of unknown function DUF552  70.79 
 
 
203 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608193  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5757  protein of unknown function DUF552  42.13 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2876  hypothetical protein  68.13 
 
 
167 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17566  normal  0.55064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1024  hypothetical protein  67.74 
 
 
175 aa  132  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.695466  hitchhiker  0.00825865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4006  hypothetical protein  61.22 
 
 
193 aa  131  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0827549  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3208  hypothetical protein  52.24 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3434  hypothetical protein  48.67 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447555  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3057  hypothetical protein  64.84 
 
 
165 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1412  hypothetical protein  66.67 
 
 
175 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3256  protein of unknown function DUF552  69.66 
 
 
267 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1421  hypothetical protein  53.49 
 
 
187 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00683826  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3796  protein of unknown function DUF552  39.17 
 
 
202 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.423363  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3193  protein of unknown function DUF552  46.4 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.749912  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5091  hypothetical protein  62.92 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153174  hitchhiker  0.00267894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1600  protein of unknown function DUF552  46.51 
 
 
164 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1289  protein of unknown function DUF552  47.29 
 
 
162 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.187686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1576  hypothetical protein  43.66 
 
 
178 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22750  hypothetical protein  44.92 
 
 
165 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.515425  normal  0.0364691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2405  protein of unknown function DUF552  53.19 
 
 
162 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.251598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1577  protein of unknown function DUF552  51.09 
 
 
176 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110571 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16510  hypothetical protein  61.64 
 
 
190 aa  99.8  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809047  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10860  hypothetical protein  51.06 
 
 
162 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0170593  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1079  protein of unknown function DUF552  48.96 
 
 
160 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208009  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13540  hypothetical protein  51.72 
 
 
210 aa  96.7  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3522  protein of unknown function DUF552  43.82 
 
 
197 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0457  cell division family protein  45.57 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0137  hypothetical protein  42.35 
 
 
159 aa  85.5  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0371341  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1486  hypothetical protein  37.78 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8946  hypothetical protein  50.67 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3321  hypothetical protein  46.67 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1083  protein of unknown function DUF552  32.67 
 
 
151 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364899  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1891  hypothetical protein  27.97 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1316  protein of unknown function DUF552  32.88 
 
 
167 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000581957  normal  0.957732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4046  protein of unknown function DUF552  29.89 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00125634  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1238  protein of unknown function DUF552  33.71 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1413  hypothetical protein  30.22 
 
 
142 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000663721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1016  protein of unknown function DUF552  32.05 
 
 
144 aa  62.4  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1035  protein of unknown function DUF552  30.21 
 
 
144 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000196256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0597  protein of unknown function DUF552  27.63 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000329372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1320  hypothetical protein  25.6 
 
 
161 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197076  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1695  protein of unknown function DUF552  27.15 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1714  protein of unknown function DUF552  27.15 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00287605  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0492  protein of unknown function DUF552  31.76 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.042492  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0859  hypothetical protein  27.78 
 
 
146 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00767621  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4907  hypothetical protein  38.96 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0835083  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2492  hypothetical protein  41.54 
 
 
117 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04571  hypothetical protein  36.71 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0594  hypothetical protein  31.46 
 
 
138 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4422  hypothetical protein  36.25 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000112454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0549  protein of unknown function DUF552  28.95 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1471  protein of unknown function DUF552  25.14 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000569683  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1730  hypothetical protein  32.22 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2900  hypothetical protein  32.73 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000121592  unclonable  0.000000137854 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0391  hypothetical protein  37.18 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04461  hypothetical protein  37.18 
 
 
191 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0691442  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04471  hypothetical protein  32.22 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.811311  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0791  hypothetical protein  25.93 
 
 
155 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000158069  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04151  hypothetical protein  37.18 
 
 
191 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2059  hypothetical protein  27.63 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976966  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5696  hypothetical protein  29.7 
 
 
124 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1905  protein of unknown function DUF552  28.18 
 
 
142 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1142  cell division protein  23.13 
 
 
180 aa  55.5  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3944  ylmF protein  31.11 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2024  hypothetical protein  35.9 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166297  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1491  cell division protein  29.33 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3951  ylmF protein  31.11 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591858  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03921  hypothetical protein  36 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2083  protein of unknown function DUF552  32.88 
 
 
315 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.009742  hitchhiker  0.00000000000013242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2107  hypothetical protein  24.72 
 
 
149 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000203247  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1821  hypothetical protein  24.72 
 
 
149 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000225081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3750  ylmF protein  32 
 
 
156 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0779289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3641  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000538076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3658  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.176518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4038  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00196777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2361  hypothetical protein  25.25 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000014385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3726  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0030403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4000  ylmF protein  32 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000660664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1241  ylmF protein  32 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000979962  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3913  ylmF protein  32 
 
 
156 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000167056 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0648  hypothetical protein  36 
 
 
188 aa  52  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802992  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1200  cell division protein  31.25 
 
 
144 aa  52  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2548  hypothetical protein  30.67 
 
 
156 aa  52  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.232838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0713  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl391  hypothetical protein  23.75 
 
 
156 aa  50.4  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00371863  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21471  hypothetical protein  34.67 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0779  hypothetical protein  26.55 
 
 
189 aa  46.2  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0367559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08920  hypothetical protein  29.21 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.235686  hitchhiker  0.0000000335802 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3318  protein of unknown function DUF552  26.14 
 
 
152 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000684072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>