43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2511 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1158    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  51.11 
 
 		 607 aa  525  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  50.78 
 
 		 551 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  50.09 
 
 		 579 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  50.09 
 
 		 579 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  50.09 
 
 		 579 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  51.76 
 
 		 572 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  46.67 
 
 		 591 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  41.7 
 
 		 543 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  45.97 
 
 		 527 aa  343  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  39.69 
 
 		 516 aa  313  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  36.5 
 
 		 557 aa  257  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  39.86 
 
 		 539 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  30.16 
 
 		 529 aa  170  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  29.92 
 
 		 527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  31.33 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  31.33 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  31.33 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  29.49 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  40.8 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  31.13 
 
 		 546 aa  151  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  27.86 
 
 		 518 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  35.28 
 
 		 498 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  29.6 
 
 		 490 aa  144  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  27.41 
 
 		 505 aa  140  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  27.69 
 
 		 508 aa  140  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  31.17 
 
 		 551 aa  139  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  34.49 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  27.13 
 
 		 563 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  39.7 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  28.27 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  38.87 
 
 		 500 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  43.07 
 
 		 472 aa  99.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  42.55 
 
 		 495 aa  94.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  34.32 
 
 		 509 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  32.2 
 
 		 529 aa  84.7  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  38.78 
 
 		 592 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  35.53 
 
 		 632 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  31.85 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  29.81 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0390  hypothetical protein  31.58 
 
 		 485 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  33.1 
 
 		 551 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  30.43 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>