More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2496 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  100 
 
 		 122 aa  247  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  74.77 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  73.87 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  68.52 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  73.87 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  73.87 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  67.59 
 
 		 124 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  67.59 
 
 		 124 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  64.81 
 
 		 124 aa  157  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  71.17 
 
 		 120 aa  153  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  61.47 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  64.22 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  62.39 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  62.39 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  66.67 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  62.39 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  61.47 
 
 		 125 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  61.47 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  60.55 
 
 		 125 aa  146  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  64.29 
 
 		 123 aa  146  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  54.1 
 
 		 125 aa  146  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  60.55 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  61.47 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  61.47 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  61.47 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  67.89 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  60.36 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  60.55 
 
 		 123 aa  143  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  60.19 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  57.8 
 
 		 124 aa  144  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  60.55 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  59.63 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  58.72 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  56.88 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  58.72 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  56.88 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  56.88 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  53.66 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  54.13 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  59.26 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  57.41 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  52.03 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  52.03 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  55.96 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  58.72 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  57.8 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  64.22 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  56.88 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  55.05 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  55.56 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  54.13 
 
 		 124 aa  130  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  50.46 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  55.96 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  55.66 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  52.29 
 
 		 122 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  53.21 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  55.05 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  61.11 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  49.54 
 
 		 153 aa  120  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  53.92 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  49.53 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  42.06 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  48.08 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  42.06 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  106  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  50.5 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  50.5 
 
 		 140 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  48.57 
 
 		 178 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  43.12 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  49.5 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  48.51 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  49.5 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  48.51 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  48.51 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  48.51 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  50 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  48.54 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  56.18 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  46.46 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  45.54 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  45.1 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  48.48 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  44.55 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  44.57 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  52.22 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  46.94 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  47.92 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  54.35 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  39.81 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  51.69 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  48.31 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  46.94 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  50 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  43.43 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  46.94 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  46.94 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  52.81 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  52.75 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  46.94 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>