150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2470 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  91.79 
 
 
532 aa  773    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  100 
 
 
437 aa  887    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  92.25 
 
 
531 aa  776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  62.89 
 
 
540 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  40.21 
 
 
499 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  37.5 
 
 
489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  40.1 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  36.75 
 
 
490 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  37.02 
 
 
444 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  37.02 
 
 
444 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  36.34 
 
 
473 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  36.28 
 
 
492 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  36.28 
 
 
492 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  35.87 
 
 
473 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  35.87 
 
 
473 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  37.59 
 
 
519 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  37.35 
 
 
507 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  37.35 
 
 
507 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  37.35 
 
 
507 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  37.35 
 
 
507 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  36.25 
 
 
492 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  37.59 
 
 
519 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  39.95 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  36.25 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  36.25 
 
 
493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  36.76 
 
 
442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  36.76 
 
 
442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  37.35 
 
 
507 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  37.35 
 
 
507 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  35.73 
 
 
444 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  35.5 
 
 
524 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  36.39 
 
 
552 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  35.99 
 
 
448 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  35.73 
 
 
448 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  34.96 
 
 
447 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  35.73 
 
 
508 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  36.52 
 
 
510 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  36.04 
 
 
508 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  33.65 
 
 
553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  37.01 
 
 
506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  36.89 
 
 
454 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  34.17 
 
 
593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  33.11 
 
 
495 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  33.94 
 
 
551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  36.19 
 
 
501 aa  196  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  32.9 
 
 
513 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  32.97 
 
 
518 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  35.45 
 
 
511 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  33.94 
 
 
534 aa  186  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  33.68 
 
 
533 aa  186  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  32.82 
 
 
464 aa  183  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  33.1 
 
 
497 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  41.8 
 
 
317 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  35.99 
 
 
355 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  44.92 
 
 
239 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  44.92 
 
 
240 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  32.12 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  32.6 
 
 
572 aa  92.8  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  26.23 
 
 
546 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  27.65 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  26.79 
 
 
442 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  28.23 
 
 
627 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  26.37 
 
 
561 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  27.66 
 
 
432 aa  87.4  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  26.65 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  33.73 
 
 
661 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  37.01 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  25.65 
 
 
485 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  28.24 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  40.54 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  32.3 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  42.86 
 
 
255 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  43.9 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  25.24 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  40.82 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  30.95 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  27.8 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  26.65 
 
 
577 aa  63.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  25.75 
 
 
526 aa  60.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  42.5 
 
 
458 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  25.54 
 
 
433 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  26.04 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  41.18 
 
 
260 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  25.97 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  25.63 
 
 
428 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  38.54 
 
 
504 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  33.93 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  33.93 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  28.19 
 
 
275 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  29.63 
 
 
538 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  33.04 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  33.04 
 
 
445 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  33.04 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  33.04 
 
 
445 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  25.35 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  25.27 
 
 
433 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  25 
 
 
436 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  25.97 
 
 
428 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  38.66 
 
 
222 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  36.78 
 
 
566 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>