More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2458 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 119 aa  236  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  62.18 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  57.76 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  53.39 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  51.28 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  50.43 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  49.56 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  50.43 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  51.72 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  46.9 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  45.69 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  45.61 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  44.35 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  47.41 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  42.48 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  43.22 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  38.79 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  42.2 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  45.22 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  52.11 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  41.23 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  43.14 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  41.23 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  40.86 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  45.57 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  45.57 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  45.57 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  37.61 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.71 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  39.09 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 288 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3439  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  33.05 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  33.63 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  38.37 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1582  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 		 354 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00260  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  52.17 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 186 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 345 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0245  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>