More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2454 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 490 aa  952    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 		 503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  44.51 
 
 		 492 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 528 aa  325  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  46.37 
 
 		 516 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 		 562 aa  317  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 521 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 		 524 aa  312  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  41.3 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 		 509 aa  309  8e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 521 aa  309  9e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  42.31 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 588 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 526 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 509 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 		 541 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  45.92 
 
 		 539 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 		 513 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 518 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 533 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 517 aa  296  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 528 aa  296  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 529 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 514 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 		 496 aa  294  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  40.37 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.45 
 
 		 537 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 536 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 		 501 aa  289  9e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 553 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 509 aa  286  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 584 aa  285  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 532 aa  279  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 508 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 516 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 		 502 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  40.08 
 
 		 535 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 540 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 481 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  42.98 
 
 		 497 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 563 aa  269  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 535 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 477 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 575 aa  267  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 524 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 		 601 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  38.77 
 
 		 517 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 514 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 517 aa  254  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  37.96 
 
 		 505 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 504 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 511 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 		 506 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 516 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 528 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 516 aa  236  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  39.52 
 
 		 528 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.74 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 514 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 495 aa  230  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 		 511 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 		 536 aa  226  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 500 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  37.06 
 
 		 500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.11 
 
 		 519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 		 534 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.02 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 503 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.14 
 
 		 626 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.58 
 
 		 485 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 594 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 		 538 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  31.26 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 		 532 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  33.91 
 
 		 501 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 		 518 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 522 aa  193  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 		 478 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.8 
 
 		 484 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.8 
 
 		 478 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 		 486 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 		 486 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>