More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2399 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 312 aa  636    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  70.83 
 
 		 307 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  69.55 
 
 		 307 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  69.77 
 
 		 307 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  71.47 
 
 		 307 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  69.03 
 
 		 307 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  69.03 
 
 		 307 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  68.39 
 
 		 307 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  66.12 
 
 		 312 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  63.02 
 
 		 310 aa  394  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  64.1 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  64.08 
 
 		 323 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  60.9 
 
 		 310 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  62.82 
 
 		 315 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  62.82 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  60.06 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  60.26 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  60.58 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  63.14 
 
 		 322 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  60.45 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  63.46 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  60.97 
 
 		 306 aa  364  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  58.2 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  59.93 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  57.84 
 
 		 321 aa  362  4e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  62.9 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  58.06 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  60.19 
 
 		 314 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  56.41 
 
 		 310 aa  341  8e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  59.81 
 
 		 314 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  54.6 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  53.97 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  52.41 
 
 		 315 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  55.59 
 
 		 340 aa  325  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  57.74 
 
 		 319 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 320 aa  318  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  51.78 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  50.32 
 
 		 307 aa  315  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  53.53 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  52.75 
 
 		 309 aa  308  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50.32 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  52.55 
 
 		 317 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  51.14 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  47.25 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  47.25 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  48.38 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  45.34 
 
 		 304 aa  298  9e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  51.47 
 
 		 306 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  48.56 
 
 		 303 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 		 316 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 		 316 aa  295  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 		 316 aa  295  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  48.87 
 
 		 302 aa  295  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.95 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  48.88 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  47.28 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  48.56 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  47.28 
 
 		 303 aa  291  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  51.47 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  46.65 
 
 		 303 aa  291  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  45.95 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  49.36 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.74 
 
 		 308 aa  288  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 323 aa  288  8e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  47.44 
 
 		 309 aa  288  8e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  46.13 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 		 298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  48.72 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.4 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  48.87 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  48.25 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  48.25 
 
 		 308 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  47.12 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 		 301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  47.12 
 
 		 302 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  48.71 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  49.2 
 
 		 309 aa  282  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 304 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  48.08 
 
 		 303 aa  281  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.38 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0689  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  47.92 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  49.2 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  48.42 
 
 		 311 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>