More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2284 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2284  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
147 aa  297  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3903  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.7 
 
 
153 aa  148  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0673  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.01 
 
 
152 aa  96.7  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  30.56 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  30.43 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.94 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  34.53 
 
 
628 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  34.81 
 
 
1394 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77786  predicted protein  35 
 
 
675 aa  67.8  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.86 
 
 
1065 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2982  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.29 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00353782  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  29.71 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.41 
 
 
607 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  28.99 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_006686  CND01320  electron transporter, putative  33.56 
 
 
741 aa  65.5  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.17 
 
 
1065 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.17 
 
 
1006 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  28.99 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.17 
 
 
1065 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  29.17 
 
 
1065 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.58 
 
 
1065 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.56 
 
 
626 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.56 
 
 
629 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  34.03 
 
 
1317 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  26.76 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0347  FAD-binding domain-containing protein  38.14 
 
 
538 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.68 
 
 
613 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.76 
 
 
608 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  29.58 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.77 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  28.99 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  30.71 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  31.91 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.08 
 
 
614 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  30 
 
 
154 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  30.28 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1473  YbhB and YbcL  28.57 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4519  flavodoxin  26.62 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.480433  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  28.47 
 
 
1065 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  30 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  30 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4377  flavodoxin  26.62 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0171898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  34.38 
 
 
602 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  28.47 
 
 
1065 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.87 
 
 
1065 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.87 
 
 
1065 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.72 
 
 
614 aa  60.1  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  28.06 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  30.14 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  28.38 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  32.41 
 
 
623 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  25.9 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  0.0000000000612205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3968  flavodoxin  25.36 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  26.62 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000023992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.87 
 
 
613 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  27.89 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  29.29 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  29.17 
 
 
144 aa  57.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000882543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  26.81 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  29.93 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  34.04 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  31.9 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  26.9 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  33.81 
 
 
631 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.52 
 
 
600 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  29.93 
 
 
595 aa  57  0.00000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 
1312 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.72 
 
 
612 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  27.73 
 
 
170 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  27.73 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  30.89 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  31.51 
 
 
1405 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  30.89 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  26.62 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  31.16 
 
 
1370 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1899  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.09 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  33.1 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  28.57 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10283  oxidoreductase, hypothetical protein (Eurofung)  29.33 
 
 
654 aa  55.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.384937  normal  0.391793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.28 
 
 
589 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.108282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.14 
 
 
594 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  28.06 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 
1403 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.73 
 
 
591 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  27.86 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.03 
 
 
595 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  27.7 
 
 
1405 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.03 
 
 
595 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04590  NADPH-ferrihemoprotein reductase, putative  28.78 
 
 
617 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.25 
 
 
610 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  29.17 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
582 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.01 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  26.05 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  33.81 
 
 
613 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  27.86 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  33.88 
 
 
1407 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  28.77 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  27.86 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  28.77 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>