More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2182 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
123 aa  237  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
142 aa  93.6  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 
135 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  46.79 
 
 
117 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  43.8 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  58.57 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  47.96 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  42.86 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
128 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  41.59 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  56.72 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  46.59 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  41.32 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  38.94 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  40.2 
 
 
116 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  55.22 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  39.8 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  37.25 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  49.25 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  58.18 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  43.01 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  36.52 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  44.78 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.71 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.71 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  43.66 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  40.59 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  40.59 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.59 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  31 
 
 
134 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  41.1 
 
 
253 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  43.08 
 
 
319 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  41.67 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  33.94 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  38.26 
 
 
252 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  28.43 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
163 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>