More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2165 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 213 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 217 aa  104  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  35.43 
 
 		 237 aa  96.3  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 227 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 220 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  36.67 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 299 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.91 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 229 aa  89  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 259 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 228 aa  85.9  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  31.79 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  35.88 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 309 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  32.26 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  30.85 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  34.44 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  51.47 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  28.26 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.49 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>