More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2154 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  48.03 
 
 		 869 aa  705    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  48.74 
 
 		 866 aa  710    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  100 
 
 		 851 aa  1686    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  47.86 
 
 		 863 aa  689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  48.74 
 
 		 866 aa  710    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  48.65 
 
 		 861 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  48.92 
 
 		 866 aa  712    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  52.75 
 
 		 848 aa  766    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.78 
 
 		 838 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  37.2 
 
 		 851 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.83 
 
 		 777 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  38.06 
 
 		 895 aa  449  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.68 
 
 		 856 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.9 
 
 		 849 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.34 
 
 		 933 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.26 
 
 		 910 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  41.05 
 
 		 1108 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  39.15 
 
 		 702 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  32.11 
 
 		 796 aa  334  5e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.6 
 
 		 863 aa  327  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.94 
 
 		 1004 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.76 
 
 		 899 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.24 
 
 		 802 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.24 
 
 		 903 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31 
 
 		 799 aa  300  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.55 
 
 		 799 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.87 
 
 		 890 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.69 
 
 		 878 aa  276  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  31.06 
 
 		 770 aa  263  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  28.81 
 
 		 590 aa  184  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  33.75 
 
 		 972 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  28.02 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23497  predicted protein  34.56 
 
 		 1891 aa  134  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  32.64 
 
 		 282 aa  134  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  32.03 
 
 		 299 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  32.03 
 
 		 299 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 287 aa  128  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  36.41 
 
 		 323 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  34.82 
 
 		 317 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  33.33 
 
 		 342 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  38.71 
 
 		 312 aa  125  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.48 
 
 		 334 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  35.02 
 
 		 345 aa  124  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.77 
 
 		 328 aa  124  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42103  ABC(ATP-binding) family transporter  32.49 
 
 		 1226 aa  123  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166966  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  32.63 
 
 		 240 aa  124  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.39 
 
 		 1448 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.78 
 
 		 325 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  34.25 
 
 		 304 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  35.04 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  36.02 
 
 		 318 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  34.6 
 
 		 312 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  36.59 
 
 		 355 aa  122  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  36.4 
 
 		 260 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  33.33 
 
 		 252 aa  122  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.21 
 
 		 321 aa  122  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  33.17 
 
 		 333 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  38.42 
 
 		 246 aa  122  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.91 
 
 		 317 aa  121  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.77 
 
 		 325 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0754  ABC transporter related  32.31 
 
 		 245 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  33.49 
 
 		 292 aa  121  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 		 307 aa  121  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 309 aa  121  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  33.48 
 
 		 311 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.28 
 
 		 305 aa  120  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 		 489 aa  120  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.65 
 
 		 305 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  34.65 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  31.65 
 
 		 319 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  33.78 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  33.78 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  29.31 
 
 		 1476 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  35.74 
 
 		 1164 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  33.04 
 
 		 920 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  34.94 
 
 		 328 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  33.99 
 
 		 315 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  32.78 
 
 		 310 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  31.36 
 
 		 295 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  32.5 
 
 		 240 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  35.78 
 
 		 595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  35.91 
 
 		 324 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  30.83 
 
 		 328 aa  119  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  36.56 
 
 		 234 aa  119  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  34.67 
 
 		 247 aa  119  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  34.25 
 
 		 588 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  28.34 
 
 		 904 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  23.16 
 
 		 1194 aa  119  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  32.55 
 
 		 319 aa  119  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  34.43 
 
 		 340 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  34.43 
 
 		 311 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  32.83 
 
 		 281 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  33.97 
 
 		 327 aa  118  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  33.33 
 
 		 244 aa  118  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  36.12 
 
 		 249 aa  118  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.42 
 
 		 248 aa  117  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.49 
 
 		 244 aa  117  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 253 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 325 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  30.17 
 
 		 244 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>