83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2143 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  100 
 
 		 301 aa  611  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  70.11 
 
 		 288 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  64.87 
 
 		 292 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  64.54 
 
 		 296 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  64.77 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  64.77 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  64.21 
 
 		 290 aa  388  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  64.41 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  63.67 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  63.12 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  63.84 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  60.35 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  57.04 
 
 		 284 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  54.55 
 
 		 283 aa  332  6e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  56.69 
 
 		 289 aa  325  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  56.69 
 
 		 289 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  53.31 
 
 		 284 aa  315  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  55.48 
 
 		 280 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  53.71 
 
 		 282 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  56.54 
 
 		 280 aa  309  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  54.64 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  54.58 
 
 		 279 aa  295  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  50.88 
 
 		 281 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  51.27 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  49.64 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  51.29 
 
 		 294 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  52 
 
 		 283 aa  271  8.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  49.45 
 
 		 283 aa  265  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  48.94 
 
 		 302 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  44.21 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  46.83 
 
 		 282 aa  255  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  41.92 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  49.12 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  43.8 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  42.76 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  43.7 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  41.33 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  41.34 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  36.93 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  33.57 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  37.5 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  31.88 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  31.54 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  31.2 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  30.04 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  30.8 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  28.32 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  27.36 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  27.72 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  29.25 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  26.26 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  26.26 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  26.26 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  27.56 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  28.21 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  28.11 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  26.24 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  26.24 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  26.28 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.34 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  24.49 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  27.72 
 
 		 304 aa  92.4  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  27.03 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  25.37 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  29.92 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  26.83 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  27.96 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  24.65 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  26.37 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  26.33 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  25 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  28.62 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  25.55 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  25.99 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  27.53 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  26.41 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  23.63 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  23.67 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  24.28 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  22.73 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  22.31 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  19.05 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>