More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2130 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 360 aa  711    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.44 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.44 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.44 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.97 
 
 		 353 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.12 
 
 		 353 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  67.44 
 
 		 375 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.62 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.62 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  59.29 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  58.22 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  59.94 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  59.89 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  58.09 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.37 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  56.98 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  50.14 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.39 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.37 
 
 		 375 aa  322  5e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  56.57 
 
 		 376 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  54.29 
 
 		 355 aa  322  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  48.73 
 
 		 355 aa  315  8e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.56 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.48 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.44 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.69 
 
 		 349 aa  301  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.53 
 
 		 377 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  46.45 
 
 		 377 aa  297  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.2 
 
 		 376 aa  295  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.98 
 
 		 343 aa  295  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  51.82 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.28 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.63 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  48.19 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  45.77 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  49.72 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.57 
 
 		 352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.03 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  43.78 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.2 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 		 344 aa  279  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.13 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.2 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.52 
 
 		 385 aa  279  7e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.44 
 
 		 348 aa  278  8e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.58 
 
 		 393 aa  278  9e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  42.94 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.77 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  51.27 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.17 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.75 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.73 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.28 
 
 		 392 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.66 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.62 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.22 
 
 		 367 aa  271  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 364 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  45.26 
 
 		 357 aa  268  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.32 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  40.72 
 
 		 355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.32 
 
 		 349 aa  266  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  41.78 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.41 
 
 		 364 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  42.62 
 
 		 361 aa  265  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  44.94 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.11 
 
 		 357 aa  262  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.62 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  52.27 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 		 345 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.04 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  42.4 
 
 		 336 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.69 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.54 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.69 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.52 
 
 		 351 aa  256  6e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.99 
 
 		 342 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.87 
 
 		 345 aa  255  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.23 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.3 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  45.48 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.78 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.94 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.5 
 
 		 357 aa  252  6e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.58 
 
 		 364 aa  252  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.58 
 
 		 364 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.43 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  41.89 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.7 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.37 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  45.77 
 
 		 384 aa  249  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  43.01 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>