211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2106 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 		 330 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  75.08 
 
 		 332 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  73.77 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  73.7 
 
 		 331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  73.52 
 
 		 325 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  73.52 
 
 		 325 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  73.52 
 
 		 325 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  71.69 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  65.63 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  63.78 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  64.71 
 
 		 328 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  65.02 
 
 		 372 aa  384  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  64.6 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  63.66 
 
 		 322 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  63.09 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  62.58 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  61.42 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  62.35 
 
 		 329 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  62.84 
 
 		 327 aa  358  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  57.96 
 
 		 330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  57.37 
 
 		 330 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  57.32 
 
 		 329 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  56.43 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  57.01 
 
 		 326 aa  346  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  56.11 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  61.77 
 
 		 328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  57.99 
 
 		 326 aa  339  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  55.11 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  55.06 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  55.97 
 
 		 330 aa  325  8.000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1356  LAO/AO transport system ATPase  55.89 
 
 		 345 aa  322  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229963  normal  0.961808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  56.51 
 
 		 346 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1173  LAO/AO transport system ATPase  52.05 
 
 		 329 aa  315  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  56.19 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  59.12 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  57.19 
 
 		 329 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  52.12 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0546  arginine/ornithine transport system ATPase  51.82 
 
 		 378 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  59.46 
 
 		 326 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  55.26 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  50.46 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  48.77 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  50.93 
 
 		 347 aa  301  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  52.63 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  51.58 
 
 		 374 aa  298  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3259  LAO/AO transport system ATPase  49.23 
 
 		 322 aa  296  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00849768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  51.25 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  50.16 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  50.81 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  49.1 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1283  arginine/ornithine transport system ATPase  50.15 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  46.15 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  52.85 
 
 		 351 aa  292  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  51.39 
 
 		 342 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  49.84 
 
 		 332 aa  289  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0280  arginine/ornithine transport system ATPase  47.42 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2695  arginine/ornithine transport system ATPase  53.07 
 
 		 351 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0911  arginine/ornithine transport system ATPase  48.64 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2041  arginine/ornithine transport system ATPase  51.27 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.749207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09151  arginine/ornithine transport system ATPase  47.19 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2129  arginine/ornithine transport system ATPase  50 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3754  arginine/ornithine transport system ATPase  49.09 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402613  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  48.77 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  47.2 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2382  arginine/ornithine transport system ATPase  49.85 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2512  arginine/ornithine transport system ATPase  50.31 
 
 		 340 aa  272  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0867  arginine/ornithine transport system ATPase  44.79 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  47.74 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  47.42 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  47.42 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  47.42 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  47.42 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3400  arginine/ornithine transport system ATPase  48.93 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  47.42 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  47.42 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0931  arginine/ornithine transport system ATPase  48.34 
 
 		 341 aa  265  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  47.1 
 
 		 331 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  46.77 
 
 		 331 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2582  arginine/ornithine transport system ATPase  48.17 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  hitchhiker  0.000151333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3946  LAO/AO transport system ATPase  47.27 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1163  arginine/ornithine transport system ATPase  44.24 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0511506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  43.56 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  40.91 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3457  arginine/ornithine transport system ATPase  48.84 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  48.62 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3113  arginine/ornithine transport system ATPase  48.31 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  hitchhiker  0.00331919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0670  arginine/ornithine transport system ATPase  46.87 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.160836  normal  0.268873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  40.76 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2015  arginine/ornithine transport system ATPase  48.92 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.805467  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0725  arginine/ornithine transport system ATPase  49.23 
 
 		 323 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254962  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1293  arginine/ornithine transport system ATPase  44.65 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  41.56 
 
 		 341 aa  235  9e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12878  predicted protein  37.79 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0496106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  41.36 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  45.04 
 
 		 319 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  41.95 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  41.83 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  43.13 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  41.79 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  38.19 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>