59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2064 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  100 
 
 		 1120 aa  2248    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  32.71 
 
 		 1126 aa  465  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  33.42 
 
 		 1121 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1120 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1120 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1120 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1118 aa  446  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1126 aa  439  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  31.87 
 
 		 1143 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  32.02 
 
 		 1124 aa  418  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1137 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  29.94 
 
 		 1154 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  28.92 
 
 		 1153 aa  355  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1128 aa  352  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1118 aa  351  4e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  28.02 
 
 		 1136 aa  347  7e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1144 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1143 aa  312  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1121 aa  311  5.9999999999999995e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1125 aa  310  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1122 aa  301  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  26.59 
 
 		 1140 aa  292  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  26.3 
 
 		 1124 aa  291  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1123 aa  289  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1125 aa  288  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1121 aa  285  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1166 aa  279  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1121 aa  278  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1121 aa  278  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  26.93 
 
 		 1130 aa  273  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1146 aa  269  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  25 
 
 		 1121 aa  262  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1151 aa  251  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  24.76 
 
 		 1133 aa  244  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1133 aa  236  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1120 aa  224  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1114 aa  192  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1045 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  22.56 
 
 		 979 aa  156  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  26.88 
 
 		 694 aa  152  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1125 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  33.16 
 
 		 352 aa  99  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  24.77 
 
 		 406 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  24.68 
 
 		 462 aa  77.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1181 aa  62.4  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  26.29 
 
 		 1109 aa  60.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  23.84 
 
 		 1207 aa  58.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  34.35 
 
 		 1228 aa  56.6  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  25.44 
 
 		 1093 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  20 
 
 		 1107 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1138 aa  48.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  24.37 
 
 		 1159 aa  47.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1159 aa  47  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  38.03 
 
 		 1159 aa  47  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1159 aa  47  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  19.85 
 
 		 1113 aa  46.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1145 aa  46.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.74 
 
 		 1207 aa  45.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  39.13 
 
 		 1082 aa  45.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>