More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2051 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2051  ABC transporter related protein  100 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  62.3 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 		 254 aa  288  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  60.16 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.63 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  61.38 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.35 
 
 		 267 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  58.13 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  56.91 
 
 		 268 aa  278  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  58.61 
 
 		 267 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  58.2 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.72 
 
 		 261 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.65 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56.4 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61 
 
 		 594 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  57.79 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  55.56 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  58.94 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61 
 
 		 594 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  56.85 
 
 		 250 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.33 
 
 		 597 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  54.8 
 
 		 261 aa  275  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  57.26 
 
 		 250 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  56.4 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  55.24 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.33 
 
 		 619 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.91 
 
 		 595 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  58.23 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  59.92 
 
 		 597 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.92 
 
 		 597 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  56.68 
 
 		 263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  56.68 
 
 		 272 aa  271  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 273 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.84 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.05 
 
 		 244 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  57.26 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  56.47 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.92 
 
 		 636 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.92 
 
 		 636 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  59.92 
 
 		 636 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.92 
 
 		 636 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  59.92 
 
 		 636 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.92 
 
 		 636 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  56.13 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 		 299 aa  268  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.09 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  57.6 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.5 
 
 		 636 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  54.51 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  55.69 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  55.69 
 
 		 274 aa  265  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.94 
 
 		 276 aa  265  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  53.6 
 
 		 256 aa  265  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  55.04 
 
 		 253 aa  264  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  53.54 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  55.73 
 
 		 275 aa  262  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0118  ABC transporter related  56.5 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.89 
 
 		 263 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  52.4 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  55.2 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.23 
 
 		 246 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  53.23 
 
 		 246 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  57.68 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.77 
 
 		 592 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  58.44 
 
 		 602 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  53.6 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  58.17 
 
 		 271 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  52.4 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.15 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  52.03 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.8 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.41 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  51.17 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  51.17 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.75 
 
 		 581 aa  259  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  53.82 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  51.61 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.78 
 
 		 567 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  52.61 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.83 
 
 		 595 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  52.44 
 
 		 262 aa  257  2e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  52.42 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.19 
 
 		 250 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.88 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  52.5 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  51.84 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  53.39 
 
 		 567 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  52.44 
 
 		 254 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  55.12 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  49.17 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  51.2 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  51.79 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  53.6 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1325  polar amino acid ABC transporter ATPase  51.97 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.5 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>