More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2049 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
245 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  48.9 
 
 
244 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  44.81 
 
 
249 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
248 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  45.22 
 
 
269 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
242 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  41.23 
 
 
239 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  40.17 
 
 
257 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  39.21 
 
 
248 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.77 
 
 
246 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  42.98 
 
 
252 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
225 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.86 
 
 
243 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  41.88 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  37.12 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
255 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  43.2 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 
243 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 
260 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
254 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 
244 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 
278 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.65 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  41.59 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
241 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 
195 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 
195 aa  118  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
245 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 
195 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
240 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 
252 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
232 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
257 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
257 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
232 aa  113  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1316  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
237 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 
245 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
286 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 
256 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  30.97 
 
 
233 aa  111  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
264 aa  111  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 
238 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
233 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 
260 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  35.04 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
252 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 
185 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
249 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
249 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
251 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.4 
 
 
242 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 
242 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
238 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 
246 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
246 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 
242 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
248 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
246 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
239 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
244 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  37.09 
 
 
259 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
252 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
252 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
249 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
252 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
266 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
244 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
240 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
247 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>