More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1990 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 364 aa  706    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  39.75 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  39.79 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0638  histidine kinase  41.18 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.509372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  36.05 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  30.91 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  35.97 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  39.22 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.03 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  34.8 
 
 		 420 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  31.76 
 
 		 393 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  35.46 
 
 		 393 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 441 aa  99.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.58 
 
 		 438 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  31.65 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.12 
 
 		 422 aa  96.3  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  35.18 
 
 		 417 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  34.8 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  36.11 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.65 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  39.9 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  38.76 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 440 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  33.2 
 
 		 445 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 423 aa  93.2  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.04 
 
 		 430 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  30.48 
 
 		 422 aa  92.8  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 407 aa  92.8  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  31.67 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.19 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  30.83 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 441 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  36.64 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.91 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  31.89 
 
 		 442 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  34.22 
 
 		 383 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  31.34 
 
 		 455 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  35.15 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  32.27 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.18 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 742 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  33.89 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 536 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.29 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  37.21 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  33.97 
 
 		 555 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  38.89 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.4 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.39 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  32.53 
 
 		 422 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  30.39 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 601 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  33.63 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  35.83 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 869 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  28.08 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 496 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  36.6 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  32.54 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  32.86 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.479931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  34.3 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  33.11 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  35.8 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2538  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 652 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3178  histidine kinase  33.33 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  32.1 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  35.71 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  37.04 
 
 		 689 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  35 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.25 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0240  histidine kinase  35.71 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  31.94 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  31.93 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  27.51 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  28.92 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>