More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1975 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  68.22 
 
 		 900 aa  1207    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  51.8 
 
 		 890 aa  809    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 875 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 888 aa  946    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 863 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 890 aa  1798    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 892 aa  891    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 889 aa  852    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  67.34 
 
 		 898 aa  1171    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 897 aa  738    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 878 aa  636    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 		 904 aa  1145    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 889 aa  912    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  50.28 
 
 		 895 aa  782    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 895 aa  885    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 876 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 878 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 876 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 864 aa  653    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 885 aa  908    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  48 
 
 		 894 aa  770    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 893 aa  892    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  50.28 
 
 		 902 aa  830    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 881 aa  844    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 898 aa  940    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 892 aa  856    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 896 aa  735    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 895 aa  848    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 893 aa  898    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 892 aa  906    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 889 aa  883    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  61.44 
 
 		 890 aa  1082    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 897 aa  1164    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 903 aa  854    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 878 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 891 aa  1019    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  67.82 
 
 		 897 aa  1161    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 874 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 889 aa  906    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.54 
 
 		 892 aa  936    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 897 aa  920    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 880 aa  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 886 aa  854    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 896 aa  871    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 897 aa  1164    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  67.45 
 
 		 898 aa  1158    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 888 aa  930    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 893 aa  776    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 879 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 874 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 876 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 881 aa  632  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 874 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 874 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 897 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 878 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 880 aa  635  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 897 aa  632  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 874 aa  631  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 897 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 865 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 879 aa  631  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 880 aa  629  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 874 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 881 aa  627  1e-178  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 884 aa  628  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 878 aa  627  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 877 aa  625  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 877 aa  625  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 886 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 892 aa  625  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 874 aa  625  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 865 aa  624  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 876 aa  625  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 903 aa  624  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 879 aa  622  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 883 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 877 aa  622  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 882 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 875 aa  621  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 931 aa  620  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 886 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 865 aa  620  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 867 aa  618  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 905 aa  619  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 874 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 874 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 876 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 876 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 868 aa  617  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 879 aa  619  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>