185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1957 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  44.56 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  39.49 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  37.91 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  30.86 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  28.87 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  34.07 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  31 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 321 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>