More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1848 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  80.47 
 
 		 469 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  82.39 
 
 		 490 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  81.3 
 
 		 467 aa  747    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  76.56 
 
 		 479 aa  675    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  81.3 
 
 		 467 aa  747    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  81.3 
 
 		 467 aa  747    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  79.57 
 
 		 479 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  100 
 
 		 479 aa  939    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  71.34 
 
 		 488 aa  618  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  62.37 
 
 		 482 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  62.37 
 
 		 482 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  61.7 
 
 		 482 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  63.3 
 
 		 483 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  62.55 
 
 		 482 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  61.7 
 
 		 482 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  61.7 
 
 		 482 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  61.36 
 
 		 480 aa  548  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  58.51 
 
 		 486 aa  537  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  63.64 
 
 		 471 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  57.67 
 
 		 486 aa  501  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  59.09 
 
 		 468 aa  498  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  56.37 
 
 		 467 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  53.66 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  48.51 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  43.93 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  42.62 
 
 		 509 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  42.62 
 
 		 509 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  42.62 
 
 		 509 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  45.14 
 
 		 485 aa  316  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  40.08 
 
 		 500 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  39.28 
 
 		 505 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  39.67 
 
 		 497 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  36.11 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  36.11 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  36.9 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  33.62 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  35.71 
 
 		 467 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  38.16 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  38.74 
 
 		 456 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  37.92 
 
 		 458 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  38.41 
 
 		 457 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  34.99 
 
 		 461 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  35.25 
 
 		 445 aa  223  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  36.3 
 
 		 470 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  35.66 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  36.32 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  35.9 
 
 		 470 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  35.9 
 
 		 470 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  36.19 
 
 		 470 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  35.56 
 
 		 469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  35.56 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  35.56 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  35.56 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  35.56 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  35.56 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  35.56 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  35.9 
 
 		 470 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  35.28 
 
 		 467 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  37.55 
 
 		 463 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  35.32 
 
 		 469 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  37.67 
 
 		 469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  35.24 
 
 		 470 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  36.32 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  36.3 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  36.61 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  37.25 
 
 		 470 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  37.73 
 
 		 455 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  35.59 
 
 		 455 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  36.01 
 
 		 456 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  36.24 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  37.16 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  38.85 
 
 		 495 aa  203  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  36.75 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  34.34 
 
 		 445 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  35.51 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  33 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  28.97 
 
 		 456 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.34 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  29.03 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 483 aa  120  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.19 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 466 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 515 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.07 
 
 		 467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.55 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.89 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.41 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.09 
 
 		 467 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.66 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>