32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1828 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0969  putative amino acid transporter  56.23 
 
 		 648 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1828  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1308    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0609  putative amino acid transporter  54.67 
 
 		 645 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6406  putative amino acid transporter  57.84 
 
 		 653 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2094  hypothetical protein  61.16 
 
 		 623 aa  725    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0848  hypothetical protein  61.74 
 
 		 658 aa  783    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5173  hypothetical protein  60.94 
 
 		 655 aa  747    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1873  hypothetical protein  60.31 
 
 		 658 aa  758    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773936  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1862  amino acid transporter  60.22 
 
 		 649 aa  734    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1789  hypothetical protein  60.91 
 
 		 658 aa  717    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4935  hypothetical protein  57.77 
 
 		 662 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00817564  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4510  putative amino acid transporter  56.94 
 
 		 647 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1599  putative amino acid transporter  55.61 
 
 		 641 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000606511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1109  hypothetical protein  52.85 
 
 		 693 aa  621  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2825  hypothetical protein  47.47 
 
 		 717 aa  612  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.195289  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3233  putative amino acid transporter  50.86 
 
 		 661 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.643169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1808  putative amino acid transporter  52.17 
 
 		 705 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0519  putative amino acid transporter  53.9 
 
 		 660 aa  567  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3939  hypothetical protein  46.7 
 
 		 667 aa  475  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0279  hypothetical protein  53.73 
 
 		 736 aa  356  5.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1035  hypothetical protein  54.03 
 
 		 717 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.46088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  23.91 
 
 		 627 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  25.82 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  23.51 
 
 		 629 aa  55.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  22.46 
 
 		 615 aa  54.7  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  24.81 
 
 		 658 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  23.65 
 
 		 682 aa  52  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  26.54 
 
 		 672 aa  51.2  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  23.08 
 
 		 614 aa  49.7  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  22.28 
 
 		 636 aa  47.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  23.87 
 
 		 654 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  23.13 
 
 		 609 aa  45.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>