242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1822 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  100 
 
 		 445 aa  874    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  34.96 
 
 		 465 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  32.96 
 
 		 456 aa  203  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  35.92 
 
 		 450 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  35.92 
 
 		 450 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  34.23 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  34.37 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  35.91 
 
 		 439 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  32.95 
 
 		 454 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  33.56 
 
 		 459 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  35.31 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  34.57 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  32.14 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  31.13 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  31.85 
 
 		 449 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  33.41 
 
 		 499 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  27.49 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.74 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  28.64 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  30.87 
 
 		 457 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  32.24 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  32.81 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  31.3 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  29.45 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  30.74 
 
 		 578 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  30.52 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  30.5 
 
 		 494 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  32.82 
 
 		 493 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  32.37 
 
 		 493 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  32.37 
 
 		 493 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  31.92 
 
 		 458 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  30.3 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  28.48 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  32.27 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  32.27 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  29.09 
 
 		 494 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  28.41 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  28.95 
 
 		 498 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  29.83 
 
 		 487 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  25.11 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  27.27 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  28.1 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  27.2 
 
 		 512 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  29.28 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  26.74 
 
 		 495 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.59 
 
 		 436 aa  93.2  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  25.78 
 
 		 495 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  26.44 
 
 		 496 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  30.08 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  28.89 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  28.28 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  24.89 
 
 		 628 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  27.43 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  29.46 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  24.14 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  30.61 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  30.25 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  26.41 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  28.98 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.78 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  25.11 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.77 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  26.97 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  21.96 
 
 		 525 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.2 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.5 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  24.77 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.84 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  25.41 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.94 
 
 		 619 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.94 
 
 		 619 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.22 
 
 		 616 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.31 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.31 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.49 
 
 		 592 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.15 
 
 		 565 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  29.51 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  26.32 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.56 
 
 		 625 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  30.82 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  23.47 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  23.12 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  29.6 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.69 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.93 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  24.28 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  25.9 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  29.67 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  23.71 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  29.32 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  29.28 
 
 		 365 aa  67  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  23.59 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  29.62 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  25.66 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  23.64 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  23.28 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>